<html><head></head><body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; ">Is this only a problem on Macs? I'd be surprised if others aren't trying to use log_negbinomial_density<div>thanks,</div><div>Mollie</div><div><br><div><div>On 15 May 2011, at 2:09 PM, Mollie Brooks wrote:</div><br class="Apple-interchange-newline"><blockquote type="cite"><div style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; ">Hi Ian,<div>Talking to a friend last night, I learned that I had to use sudo to delete /usr/local/admb (I'm really new to this type of programming.) So I did that this morning and changed ./.bashrc to have </div><div><span class="Apple-style-span" style="font-family: Calibri, sans-serif; font-size: 15px; ">export ADMB_HOME= /Users/molliebrooks/Desktop/admb-10.1/build/admb-10.1-macos10.6.7-xcode3.2.5-64bit/</span></div><div><font class="Apple-style-span" face="Calibri, sans-serif" size="4"><span class="Apple-style-span" style="font-size: 15px;"><br></span></font></div><div><font class="Apple-style-span" face="Calibri, sans-serif" size="4"><span class="Apple-style-span" style="font-size: 15px;">How do  I "rerun .bashrc"?</span></font></div><div><font class="Apple-style-span" face="Calibri, sans-serif" size="4"><span class="Apple-style-span" style="font-size: 15px;">After making these changes, I tried to run my program again (even thought I haven't debugged lgam yet) and I got this error:</span></font></div><div><font class="Apple-style-span" face="Calibri, sans-serif" size="4"><span class="Apple-style-span" style="font-size: 15px;"><br></span></font></div><div><font class="Apple-style-span" face="Calibri, sans-serif" size="4"><span class="Apple-style-span" style="font-size: 15px;"><div>mollie-brookss-macbook-4:~ molliebrooks$ cd /Users/molliebrooks/Desktop/UF\ ADMB\ May\ Workshop/examples/FirFecundity/</div><div>mollie-brookss-macbook-4:FirFecundity molliebrooks$ admb firdbhfec</div><div>/usr/local/bin/admb: fork: Resource temporarily unavailable</div><div><br></div><div>So I guess that means that specifying ADMB HOME does nothing? </div><div>Should I move some admb files to /usr/local/bin?</div><div>thanks,</div><div>Mollie</div><div><font class="Apple-style-span" face="Helvetica"><span class="Apple-style-span" style="font-size: medium;"><font class="Apple-style-span" face="Calibri, sans-serif" size="4"><span class="Apple-style-span" style="font-size: 15px;"><br></span></font></span></font></div></span></font><div><div>On 14 May 2011, at 8:06 PM, Ian Taylor wrote:</div><br class="Apple-interchange-newline"><blockquote type="cite"><span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; font-family: Helvetica; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; -webkit-text-decorations-in-effect: none; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px; font-size: medium; "><div lang="EN-US" link="blue" vlink="purple"><div class="WordSection1" style="page: WordSection1; "><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "><span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; ">Dave’s suggestion will hopefully fix everything.<o:p></o:p></span></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "><span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; ">But if you say that things are imbedded deeper, that could also be the reason it didn’t find the new version.<o:p></o:p></span></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "><span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; ">change ADMB_HOME to /Users/molliebrooks/Desktop/admb-10.1/build/admb-10.1-macos10.6.7-xcode3.2.5-64bit/<o:p></o:p></span></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "><span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; ">then rerun .bashrc<o:p></o:p></span></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "><span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; ">and then try again. ADMB_HOME/bin has to contain the admb, adcomp, and adlink.<o:p></o:p>< mal><span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; ">-Ian<o:p></o:p></span></span></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "><span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; "><o:p> </o:p></span></div><div style="border-top-style: none; border-right-style: none; border-bottom-style: none; border-width: initial; border-color: initial; border-left-style: solid; border-left-color: blue; border-left-width: 1.5pt; padding-top: 0in; padding-right: 0in; padding-bottom: 0in; padding-left: 4pt; "><div><div style="border-right-style: none; border-bottom-style: none; border-left-style: none; border-width: initial; border-color: initial; border-top-style: solid; border-top-color: rgb(181, 196, 223); border-top-width: 1pt; padding-top: 3pt; padding-right: 0in; padding-bottom: 0in; padding-left: 0in; "><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "><b><span style="font-size: 10pt; font-family: Tahoma, sans-serif; ">From:</span></b><span style="font-size: 10pt; font-family: Tahoma, sans-serif; "><span class="Apple-converted-space"> </span>Mollie Brooks [mailto:mbrooks@ufl.edu]<span class="Apple-converted-space"> </span><br><b>Sent:</b><span class="Apple-converted-space"> </span>Saturday, May 14, 2011 4:11 PM<br><b>To:</b><span class="Apple-converted-space"> </span>Ian Taylor<br><b>Subject:</b><span class="Apple-converted-space"> </span>Re: [ADMB Users] lgam in 10.0<o:p></o:p></span></div></div></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "><o:p> </o:p></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; ">Thanks Ian for trying to help. I can't get either of those solutions to work. <o:p></o:p></div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; ">I can't delete /usr/local/admb because I don't have permission and I can't mod</div></div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "><o:p> </o:p></div></div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; ">I tried to rename the files you suggested. They are imbedded deeper than I expected<o:p></o:p></div></div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; ">/Users/molliebrooks/Desktop/admb-10.1/build/admb-10.1-macos10.6.7-xcode3.2.5-64bit/bin<o:p></o:p></div></div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; ">When I tried to <span class="apple-style-span"><span style="font-family: Calibri, sans-serif; ">look for every instance of “adcomp” or “adlink” and change them to “adcompNew” and “adlinkNew” there was only one instance of "adlink" and none of "adcomp" in admbNEW.</span></span><o:p></o:p></div></div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "><o:p> </o:p></div></div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "><span class="apple-style-span"><span style="font-family: Calibri, sans-serif; ">I think I should just give up on this. I was hoping to show some students an example and exercise using log_negbinomial_densit this hard to get it working, then I can't expect them to get it and should put my efforts into other examples and exercises. I'll just avoid negative binomial data for a while.</span></span><o:p></o:p></div></div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "><span class="apple-style-span"><span style="font-family: Calibri, sans-serif; ">-Mollie</span></span><o:p></o:p></div></div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "><o:p> </o:p></div></div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "><o:p> </o:p></div><div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; ">On 14 May 2011, at 5:55 PM, Ian Taylor wrote:<o:p></o:p></div></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "><br><br><o:p></o:p></div><div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "><span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; ">Hi Mollie,</span><o:p></o:p></div></div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "><span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; ">Thanks to your modifying the path, your computer now has two places where it can search for ADMB binaries:</span><o:p></o:p></div></div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "><span>/usr/local/, and the folder on your desktop. Unfortunately, when you call admb, it appears to go to /usr/local/ first and never sees the new version. You can tell this because the command</span><o:p></o:p></div></div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "><span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; ">               <span class="apple-converted-space"> </span></span><span style="font-family: Calibri, sans-serif; ">g++  -O3 -L/usr/local/admb/lib</span><o:p></o:p></div></div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "><span style="font-family: Calibri, sans-serif; ">includes the location /usr/local/ and does not include your new location.</span><o:p></o:p></div></div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "><span style="font-family: Calibri, sans-serif; "> </span><o:p></o:p></div></div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "><span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; ">What I would do is delete the entire /usr/local/admb/ you won’t have this problem.</span><o:p></o:p></div></div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "><span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; ">An alternative is to go to<span class="apple-converted-space"> </span></span><span style="font-family: Calibri, sans-serif; ">/Users/molliebrooks/Desktop/admb-10.1//build/bin/ and rename 3 files</span><o:p></o:p></div></div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "><span style="font-family: Calibri, sans-serif; ">            admb to admbNew</span><o:p></o:p></div></div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "><span style="font-family: Calibri, sans-serif; ">&nbs ;       adcomp to adcompNew</span><o:p></o:p></div></div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "><span style="font-family: Calibri, sans-serif; ">            adlink to adlinkNew</span><o:p></o:p></div></div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "><span style="font-family: Calibri, sans-serif; ">(or whateve r). Then edit the file admbNew and look for every instance of “adcomp” or “adlink” and change them to “adcompNew” and “adlinkNew”. Now you should have two independent methods of compiling ADMB by calling either admb or admbNew.</span><o:p></o:p></div></div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "><span style="font-family: Calibri, sans-serif; "> </span><o:p></o:p></div></div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "><span style="font-family: Calibri, sans-serif; ">-Ian</span><o:p></o:p></div></div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "><span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; "> </span><o:p></o:p></div></div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "> <o:p></o:p></div></div><div style="border-top-style: none; border-right-style: none; border-bottom-style: none; border-width: initial; border-color: initial; border-left-style: solid; padding-top: 0in; padding-right: 0in; padding-bottom: 0in; padding-left: 4pt; border-width: initial; border-color: initial; "><div><div style="border-right-style: none; border-bottom-style: none; border-left-style: none; border-width: initial; border-color: initial; border-top-style: solid; padding-top: 3pt; padding-right: 0in; padding-bottom: 0in; padding-left: 0in; border-width: initial; border-color: initial; "><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "><b><span style="font-size: 10pt; ">From:</span></b><span class="apple-converted-space"><span style="font-size: 10pt; font-family: Tahoma, sans-serif; "> </span></span><span style="font-size: 10pt; font-family: Tahoma, sans-serif; "><a href="mailto:users-bounces@admb-project.org" style="color: blue; text-decoration: underline; ">users-bounces@admb-project.org</a><span class="apple-converted-space"> </span>[mailto:users-bounces@admb-project.org]<span class="apple-converted-space"> </span><b>On Behalf Of<span class="apple-converted-space"> </span></b>Mollie Brooks<br><b>Sent:</b><span class="apple-converted-space"> </span>Saturday, May 14, 2011 2:11 PM<br><b>To:</b><span class="apple-converted-space"> </span><a href="mailto:users@admb-project.org" style="color: blue; text-decoration: underline; ">users@admb-project.org</a><br><b>Subject:</b><span class="apple-converted-space"> </span>Re: [ADMB Users] lgam in 10.0</span><o:p></o:p></div></div></div></div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "> <o:p></o:p></div></div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; ">Hi, <o:p></o:p></div></div><div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; ">Just swer my own question, I downloaded the source for 10.1 and followed the instructions in README.txt for Unix and GNU g++ since there weren't instructions for Macs. The install seems to have worked, but I no ace the version in /usr/local/<o:p></o:p></div></div></div><div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; ">So I edited the file ./.bashrc to now have the lines<o:p></o:p></div></div></div><div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "> <o:p></o:p></div></div></div><div><div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; ">export ADMB_HOME=/Users/molliebrooks/Desktop/admb-10.1//build<o:p></o:p></div></div></div><div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; ">export PATH=$ADMB_HOME/bin:$PATH<o:p></o:p></div></div></div></div><div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "> <o:p></o:p></div></div></div><div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; ">because I think that's the location of the necessary files. Then I reran the model and still got the error for lgam<o:p></o:p></div></div></div><div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "> <o:p></o:p></div></div></div><div><div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; ">*** Linking: adlink /div></div></div><div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; ">g++  -O3 -L/usr/local/admb/lib firdbhfec.o -ldf1b2o -ladmod -ladt -lado -ldf1b2o -ladmod -ladt -lado -o firdbhfec<o:p></o:p></div></div></div><div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; ">ld: duplicate symbol lgam(double)in /usr/local/admb/lib/libado.a(cgamdev.obj) libdf1b2o.a(df13tester.obj)<o:p></o:p></div></div></div><div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; ">collect2: ld returned 1 exit status<o:p></o:p></div></div></div></div><div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "> <o:p></o:p></div></div></div><div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; ">So I found all the instances of "lgam" in df13tester.cpp<o:p></o:p></div></div></div><div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; ">How much of this should I comment out? Is it just the definition of lgam(double) lines 943 to 1050? What about lines 309 and 314?<o:p></o:p></div></div></div><div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "> <o:p></o:p></div></div></div><div><div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "><span style="font-size: 8.5pt; font-family: Menlo, serif; color: rgb(208, 0, 160); ">double</span><span ace=""><span style="font-size: 8.5pt; font-family: Menlo, serif; color: black; "> </span></span><span style="font-size: 8.5pt; font-family: Menlo, serif; color: black; ">lgam (<span class="apple-converted-space"> </span></span><span style="font-size: 8.5pt; font-family: Menlo, serif; color: rgb(208, 0, 160); ">double</span><span class="apple-converted-space"><span style="font-size: 8.5pt; font-family: Menlo, serif; color: black; "> </span></span><span style="font-size: 8.5pt; font-family: Menlo, serif; color: black; ">);</span><o:p></o:p></div></div></div></div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "><span style="font-size: 13.5pt; font-family: Helvetica, sans-serif; ">double</span><span class="apple-converted-space"><span style="font-size: 8.5pt; font-family: Menlo, serif; color: black; "> </span></span><span style="font-size: 8.5pt; font-family: Menlo, serif; color: black; ">lgam();</span><span style="font-size: 13.5pt; font-family: Helvetica, sans-serif; "><o:p></o:p></span></div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "><span><o:p> </o:p></span></div></div></div><div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "><span style="color: black; "> </span><o:p></o:p></div></div></div></div><div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; ">thanks,<o:p></o:p></div></div></div><div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; ">Mollie<o:p></o:p></div></div></div><div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "> <o:p></o:p></div></div></div><div><div><div><div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "><span style="font-size: 9pt; ">Mollie Brooks</span><o:p></o:p></div></div></div><div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "><span style="font-size: 9pt; ">Ph.D. Candidate</span><o:p></o:p></div></div></div><div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "><span style="font-size: 9pt; ">NSF IGERT Fellow</span><o:p></o:p></div></div></div><div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "><span style="font-size: 9pt; ">Biology Department</span><o:p></o:p></div></div></div><div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "><span style="font-size: 9pt; ">University of Florida</span><o:p></o:p></div></div></div><div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "><span style="font-size: 9pt; "><a href="mailto:mbrooks@ufl.eduan%3E%3Co:p%3E%3C/o:p%3E%3C/p%3E%3C/div%3E%3C/div%3E%3Cdiv%3E%3Cdiv%3E%3Cp%20class=MsoNormal%3E%3Cspan%20style='font-size:9.0pt'%3E%3Ca%20href=" http:="" www.zoology.ufl.edu="" mbrooks"="" style="color: blue; text-decoration: underline; ">www.zoology.ufl.edu/mbrooks</a></span><o:p></o:p></div></div></div><div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "><span style="font-size: 9pt; "> </span><o:p></o:p></div></div></div></div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "> <o:p></o:p></div></div></div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "> <o:p></o:p></div></div><div><div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; ">On 14 May 2011, at 3:12 PM, Mollie Brooks wrote:<o:p></o:p></div></div></div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "><br><br><br><o:p></o:p></div></div><div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; ">Hi ADMBers,<o:p></o:p></div></div><div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; ">I'm running 10.0 on a mac and this old problem seems to have reoccurred<o:p></o:p></div></div></div><div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "><a href="http://groups.google.com/group/admb-users/browse_thread/thread/2e82a6c63586c83e" style="color: blue; text-decoration: underline; ">http://groups.google.com/group/admb-users/browse_thread/thread/2e82a6c63586c83e</a><o:p></o:p></div></div></div><di> <o:p></o:p><div><br class="webkit-block-placeholder"></div></di></div></div><div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; ">The messag ><o:p></o:p></div></div></div><div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; ">*** Linking: adlink firdbhfec<o:p></o:p></div></div></div><div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; ">g++  -O3 -L/usr/local/admb/lib firdbhfec.o -ldf1b2o -ladmod -ladt -lado -ldf1b2o -ladmod -ladt -lado -o firdbhfec<o:p></o:p></div></div></div><div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; ">ld: duplicate symbol lgam(double)in /usr/local/admb/lib/libado.a(cgamdev.obj) and /usr/local/admb/lib/libdf1b2o.a(df13tester.obj)<o:p></o:p></div></div></div><div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; ">collect2: ld returned 1 exit status<o:p></o:p></div></div></div><div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "> <o:p></o:p></div></div></div><div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; ">Is this fixed in version 10.1? I saw in the readme.txt file that there was a fix to <span class="apple-style-span"><span style="font-family: 'Courier New'; ">gammln functions.</span></span><o:p></o:p></div></div></div><div><div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "><span class="apple-styl" family:"courier="" new"'="">thanks,</span><o:p></o:p></div></div></div></div></div></div></div></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif; "><o:p> </o:p></div></div></div></div></span></blockquote></div><br></div></div>_______________________________________________<br>Users mailing list<br><a href="mailto:Users@admb-project.org">Users@admb-project.org</a><br>http://lists.admb-project.org/mailman/listinfo/users<br></blockquote></div><br></div></body></html>