Good afternoon,<br /><br />I'm running glmmADMB (0.5-2) with negative binomial and zinegbin distribution on count data in R (version 2.12.2).  Currently I'm using a cluster (www.sharcnet.ca) to submit multiple datasets to be analyzed by the same R program in parallel (i.e., serial farming). <br /><br />Other R packages work fine in parallel this way (e.g., glmer), and the code for ADMB works fine on a single dataset.  However, as soon as I submit a second dataset to be analyzed in parallel, ADMB fails with the following error messages:<br /><br /> Error in dvar_matrix write<br />Error in glmm.admb(ObservationCount ~ c.year + poly(c.day, 2) + poly(c.hour,  : <br />  The function maximizer failed<br />Calls: glmm.zinb.trnd.admb.yr -> glmm.admb<br />In addition: Warning messages:<br />1: In system(cmd2, intern = !verbose) :<br />  line 1 may be truncated in call to system(, intern = TRUE)<br />2: In system(cmd2, intern = !verbose) :<br />  line 1 may be truncated in call to system(, intern = TRUE)<br />3: In system(cmd2, intern = !verbose) :<br />  line 1 may be truncated in call to system(, intern = TRUE)<br />4: In system(cmd2, intern = !verbose) :<br />  line 1 may be truncated in call to system(, intern = TRUE)<br />5: running command './nbmm -maxfn 500 ' had status 1 <br />Execution halted<br /><br />I searched these error messages online, and haven't found any documentation.  Question is, is it possible to run ADMB in parallel?  I suspect (with my very limited knowledge) that the error may have to do with how temporary files are written/stored by ADMB??  <br /><br />I haven't attached sample data, because for now I'd simply like to know if parallel processing is possible with ADMB? If so, is there documentation that could help me out?  I am also happy to supply data and R code if it will help.<br /><br />Thanks so much,<br /><br />Tara<br /><br /><div>--</div>Tara L. Crewe, PhD Candidate<br /><br />Department of Biology<br />University of Western Ontario<br />1151 Richmond Street<br />London, Ontario, Canada, <br />N6A 3K7<br /><br />Tel: 519-661-2111 x 84646<br />email: tcrewe2@uwo.ca