Hi Mollie,<div><br></div><div>Last weekend I was playing around with MCMC's in ADMB and I found no difference when using mcgrope with different values. So, I'm not exactly sure how that works. The reason that I was playing with mcgrope was that the ADMB MCMC wasn't traversing the wide space seen with another (unnamed) model.  However, playing with -mcrb  worked by allowing the MCMC to jump to farther areas.  It may be worth a try.</div>
<div><br></div><div>I hope this helps,</div><div>Allan<br><br><div class="gmail_quote">On Wed, Mar 21, 2012 at 2:07 PM, Mollie Brooks <span dir="ltr"><<a href="mailto:mbrooks@ufl.edu">mbrooks@ufl.edu</a>></span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">Thanks Dave. In that case, I think I'll try getting more samples. I might try mcgrope, but I would have to first make sure that I could explain it in a publication-worthy way.<br>

<span class="HOEnZb"><font color="#888888">Mollie<br>
</font></span><div class="HOEnZb"><div class="h5"><br>
<br>
<br>
On 21 Mar 2012, at 3:04 PM, dave fournier wrote:<br>
<br>
> To the extent that all is working the results should be identical. I checked this with a trivial model.<br>
> For a real world example there could be differences as at some point a candidate point on the<br>
> boundary of being accepted/rejected could be rejected/accepted.<br>
> _______________________________________________<br>
> Users mailing list<br>
> <a href="mailto:Users@admb-project.org">Users@admb-project.org</a><br>
> <a href="http://lists.admb-project.org/mailman/listinfo/users" target="_blank">http://lists.admb-project.org/mailman/listinfo/users</a><br>
><br>
<br>
_______________________________________________<br>
Users mailing list<br>
<a href="mailto:Users@admb-project.org">Users@admb-project.org</a><br>
<a href="http://lists.admb-project.org/mailman/listinfo/users" target="_blank">http://lists.admb-project.org/mailman/listinfo/users</a><br>
</div></div></blockquote></div><br></div>